Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM27E3Q08E93 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM27E3Q08E93 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms