Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE4DQ08499 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms