Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 ERP3YDL018C 678 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 DTD1YDL219W 453 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 PPH3YDR075W 927 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 SNO3YFL060C 669 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 TAD1YGL243W 1203 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 UPF3YGR072W 1164 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 RPS5YJR123W 678 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 ELO3YLR372W 1038 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 IRC21YMR073C 606 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 SSO2YMR183C 888 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 FMP41YNL168C 780 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YNL324WYNL324W 396 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 SNO2YNL334C 669 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 GLN1YPR035W 1113 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YPR114WYPR114W 948 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 BMT2YBR141C 1014 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 STR2YJR130C 1920 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 GGA1YDR358W 1674 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 ADE6YGR061C 4077 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 UBC9YDL064W 474 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 MIX14YDR031W 366 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YDR157WYDR157W 402 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YHR173CYHR173C 339 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 PET130YJL023C 1044 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 KKQ8YKL168C 2175 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 CDC123YLR215C 1083 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 HAP3YBL021C 435 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 RCL1YOL010W 1104 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 WRS1YOL097C 1299 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YOL163WYOL163W 510 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YOR366WYOR366W 354 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 PPT2YPL148C 522 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 SPO23YBR250W 1572 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YCL002CYCL002C 792 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 APM2YHL019C 1818 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 NOC4YPR144C 1659 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 KRE29YER038C 1395 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 MSA1YOR066W 1890 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 PGK1YCR012W 1251 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 BET1YIL004C 429 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 MOG1YJR074W 657 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 CAP1YKL007W 807 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 MRP49YKL167C 414 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 PPG1YNR032W 1107 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 PEX15YOL044W 1152 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 SYC1YOR179C 567 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 RCN2YOR220W 798 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 ADE3YGR204W 2841 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 ITT1YML068W 1395 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YHL017WYHL017W 1599 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 IDS2YJL146W 1410 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 PHO5YBR093C 1404 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YCL076WYCL076W 744 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 GVP36YIL041W 981 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 RNA1YMR235C 1224 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YNL046WYNL046W 519 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 NIS1YNL078W 1224 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 SPS18YNL204C 903 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 CMR3YPR013C 954 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 GIP1YBR045C 1920 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 COT1YOR316C 1320 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 FRE1YLR214W 2061 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 STP4YDL048C 1473 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 CPS1YJL172W 1731 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 TAF10YDR167W 621 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YDR248CYDR248C 582 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 WBP1YEL002C 1293 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 BUD25YER014C-A 462 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YGR122WYGR122W 1209 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YLR257WYLR257W 966 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 RIB4YOL143C 510 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 MCA1YOR197W 1299 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YPR123CYPR123C 435 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 ATG1YGL180W 2694 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 RCK2YLR248W 1833 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 RCM1YNL022C 1473 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 ATG4YNL223W 1485 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 MNN5YJL186W 1761 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 FAA3YIL009W 2085 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 FRS2YFL022C 1512 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 NAT2YGR147C 867 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 CAB4YGR277C 918 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 YML047W-AYML047W-A 366 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 TRM10YOL093W 882 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 SPR2YOR214C 711 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO1Q08236 HRP1YOL123W 1605 nt5.4□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 RAD24YER173W 1980 nt5.4□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 GZF3YJL110C 1656 nt5.4□□□□□ -1.55
AVO1Q08236 RFT1YBL020W 1725 nt5.4□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.4 ms