Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXM1Q08050 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXM1Q08050 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms