Protein–RNA interactions for Protein: Q06629

HDA2, HDA1 complex subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA2Q06629 MCM3YEL032W 2916 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 GAT2YMR136W 1683 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 ABZ1YNR033W 2364 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 KNH1YDL049C 807 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 NUS1YDL193W 1128 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 MST27YGL051W 705 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 TDA10YGR205W 873 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 LIN1YHR156C 1023 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YJL147CYJL147C 1149 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YJR011CYJR011C 786 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 MST28YAR033W 705 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA2Q06629 IDS2YJL146W 1410 nt5.4□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 ATG4YNL223W 1485 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 MKK2YPL140C 1521 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 GTR2YGR163W 1026 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YIL163CYIL163C 354 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 SYS1YJL004C 612 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 STE18YJR086W 333 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 SFC1YJR095W 969 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 THI11YJR156C 1023 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 MRP49YKL167C 414 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 CDC123YLR215C 1083 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YNL035CYNL035C 1170 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 PYC1YGL062W 3537 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 ERG9YHR190W 1335 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YLR446WYLR446W 1302 nt5.39□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 HAP4YKL109W 1665 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 FCF1YDR339C 570 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YFL051CYFL051C 483 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 EGD2YHR193C 525 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YHC1YLR298C 696 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 ECM19YLR390W 339 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 TUM1YOR251C 915 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YPR078CYPR078C 1119 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 RPN7YPR108W 1290 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 KAR4YCL055W 1008 nt5.38□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 MNS1YJR131W 1650 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YCR001WYCR001W 315 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YDR248CYDR248C 582 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 WBP1YEL002C 1293 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 UBC8YEL012W 657 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YGR160WYGR160W 612 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 MIC26YGR235C 702 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YVH1YIR026C 1095 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YPT52YKR014C 705 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 RPS30AYLR287C-A 192 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 RPN13YLR421C 471 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 CDC28YBR160W 897 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 ERV15YBR210W 429 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 ADE12YNL220W 1302 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 RAD18YCR066W 1464 nt5.37□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 RAD24YER173W 1980 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 NOP16YER002W 696 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YGR042WYGR042W 816 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 RPE1YJL121C 717 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 ELO3YLR372W 1038 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YMR130WYMR130W 909 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 ARF3YOR094W 552 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 ALG14YBR070C 714 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 MLC2YPR188C 492 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YCL002CYCL002C 792 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YDR131CYDR131C 1671 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 AI4Q0065 1671 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 MIH1YMR036C 1665 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YFL042CYFL042C 2025 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 SUM1YDR310C 3189 nt5.36□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YIR007WYIR007W 2295 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 SST2YLR452C 2097 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 RKM3YBR030W 1659 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 ASF2YDL197C 1578 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 APN2YBL019W 1563 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 SOF1YLL011W 1470 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 TDA6YPR157W 1404 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 COT1YOR316C 1320 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 TAD1YGL243W 1203 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 PHB1YGR132C 864 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 CIN4YMR138W 576 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YPR172WYPR172W 603 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 SSA2YLL024C 1920 nt5.35□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 MCM4YPR019W 2802 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YBR139WYBR139W 1527 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 PUF2YPR042C 3228 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 LAP3YNL239W 1365 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 DTD1YDL219W 453 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YGL082WYGL082W 1146 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 ZRT1YGL255W 1131 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 YGR176WYGR176W 348 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 MNN11YJL183W 1269 nt5.34□□□□□ -1.55
HDA2Q06629 GPX1YKL026C 504 nt5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.5 ms