Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABPB1Q06547 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABPB1Q06547 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms