Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NHLH1Q02575 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms