Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF8Q02556 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF8Q02556 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IRF8Q02556 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF8Q02556 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF8Q02556 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF8Q02556 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF8Q02556 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF8Q02556 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IRF8Q02556 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF8Q02556 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF8Q02556 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF8Q02556 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms