Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCN7AQ01118 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCN7AQ01118 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCN7AQ01118 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms