Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNA1BQ00975 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1BQ00975 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms