Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDKL1Q00532 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL1Q00532 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms