Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA4Q00056 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA4Q00056 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms