Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED6P86452 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED6P86452 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED6P86452 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED6P86452 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED6P86452 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED6P86452 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED6P86452 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED6P86452 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED6P86452 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED6P86452 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED6P86452 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED6P86452 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZBED6P86452 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED6P86452 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms