Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF5P84085 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF5P84085 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF5P84085 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF5P84085 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF5P84085 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF5P84085 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF5P84085 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF5P84085 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF5P84085 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF5P84085 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF5P84085 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF5P84085 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF5P84085 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF5P84085 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF5P84085 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF5P84085 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF5P84085 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF5P84085 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF5P84085 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF5P84085 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF5P84085 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF5P84085 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF5P84085 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF5P84085 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF5P84085 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF5P84085 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF5P84085 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF5P84085 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF5P84085 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF5P84085 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF5P84085 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF5P84085 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF5P84085 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF5P84085 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF5P84085 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF5P84085 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF5P84085 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF5P84085 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF5P84085 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF5P84085 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF5P84085 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF5P84085 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF5P84085 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF5P84085 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF5P84085 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF5P84085 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF5P84085 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF5P84085 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF5P84085 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF5P84085 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF5P84085 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF5P84085 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF5P84085 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF5P84085 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF5P84085 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARF5P84085 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARF5P84085 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARF5P84085 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARF5P84085 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF5P84085 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF5P84085 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF5P84085 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF5P84085 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF5P84085 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF5P84085 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF5P84085 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF5P84085 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF5P84085 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF5P84085 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF5P84085 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF5P84085 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms