Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIM1P81133 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SIM1P81133 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIM1P81133 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIM1P81133 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIM1P81133 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIM1P81133 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIM1P81133 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIM1P81133 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIM1P81133 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIM1P81133 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SIM1P81133 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SIM1P81133 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIM1P81133 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIM1P81133 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIM1P81133 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIM1P81133 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIM1P81133 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIM1P81133 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIM1P81133 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIM1P81133 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIM1P81133 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIM1P81133 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIM1P81133 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIM1P81133 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIM1P81133 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIM1P81133 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIM1P81133 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIM1P81133 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIM1P81133 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIM1P81133 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIM1P81133 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIM1P81133 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIM1P81133 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIM1P81133 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIM1P81133 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIM1P81133 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIM1P81133 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIM1P81133 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIM1P81133 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIM1P81133 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIM1P81133 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIM1P81133 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SIM1P81133 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIM1P81133 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIM1P81133 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIM1P81133 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIM1P81133 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIM1P81133 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIM1P81133 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIM1P81133 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIM1P81133 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIM1P81133 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIM1P81133 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIM1P81133 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIM1P81133 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIM1P81133 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIM1P81133 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIM1P81133 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIM1P81133 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIM1P81133 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIM1P81133 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIM1P81133 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIM1P81133 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SIM1P81133 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SIM1P81133 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIM1P81133 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIM1P81133 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIM1P81133 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIM1P81133 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIM1P81133 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIM1P81133 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIM1P81133 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIM1P81133 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIM1P81133 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIM1P81133 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIM1P81133 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SIM1P81133 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIM1P81133 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIM1P81133 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIM1P81133 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIM1P81133 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms