Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFI35P80217 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFI35P80217 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFI35P80217 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFI35P80217 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFI35P80217 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFI35P80217 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFI35P80217 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFI35P80217 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFI35P80217 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFI35P80217 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFI35P80217 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFI35P80217 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFI35P80217 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFI35P80217 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFI35P80217 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFI35P80217 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFI35P80217 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFI35P80217 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFI35P80217 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFI35P80217 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFI35P80217 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFI35P80217 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFI35P80217 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFI35P80217 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFI35P80217 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFI35P80217 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFI35P80217 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFI35P80217 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFI35P80217 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFI35P80217 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFI35P80217 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFI35P80217 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFI35P80217 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFI35P80217 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFI35P80217 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFI35P80217 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFI35P80217 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFI35P80217 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFI35P80217 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFI35P80217 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFI35P80217 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFI35P80217 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFI35P80217 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFI35P80217 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFI35P80217 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFI35P80217 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFI35P80217 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFI35P80217 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFI35P80217 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFI35P80217 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFI35P80217 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFI35P80217 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFI35P80217 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFI35P80217 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFI35P80217 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFI35P80217 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFI35P80217 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFI35P80217 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFI35P80217 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFI35P80217 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFI35P80217 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFI35P80217 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFI35P80217 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFI35P80217 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFI35P80217 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFI35P80217 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFI35P80217 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFI35P80217 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFI35P80217 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFI35P80217 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFI35P80217 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFI35P80217 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFI35P80217 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFI35P80217 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFI35P80217 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFI35P80217 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFI35P80217 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFI35P80217 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFI35P80217 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFI35P80217 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFI35P80217 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFI35P80217 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFI35P80217 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFI35P80217 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms