Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEP78395 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms