Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBG1P69891 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBG1P69891 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HBG1P69891 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HBG1P69891 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBG1P69891 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBG1P69891 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBG1P69891 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBG1P69891 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBG1P69891 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBG1P69891 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBG1P69891 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBG1P69891 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBG1P69891 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBG1P69891 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBG1P69891 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HBG1P69891 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HBG1P69891 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBG1P69891 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBG1P69891 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBG1P69891 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBG1P69891 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBG1P69891 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBG1P69891 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HBG1P69891 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBG1P69891 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBG1P69891 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBG1P69891 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBG1P69891 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBG1P69891 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBG1P69891 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBG1P69891 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HBG1P69891 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBG1P69891 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBG1P69891 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBG1P69891 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBG1P69891 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBG1P69891 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBG1P69891 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBG1P69891 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBG1P69891 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBG1P69891 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBG1P69891 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HBG1P69891 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBG1P69891 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HBG1P69891 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBG1P69891 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBG1P69891 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HBG1P69891 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBG1P69891 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBG1P69891 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBG1P69891 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBG1P69891 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBG1P69891 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HBG1P69891 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HBG1P69891 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBG1P69891 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBG1P69891 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBG1P69891 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBG1P69891 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBG1P69891 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBG1P69891 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBG1P69891 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBG1P69891 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBG1P69891 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBG1P69891 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HBG1P69891 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HBG1P69891 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HBG1P69891 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HBG1P69891 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms