Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTG1P63261 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG1P63261 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms