Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUMO1P63165 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SUMO1P63165 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms