Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSNL1P62760 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VSNL1P62760 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms