Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23AP62750 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL23AP62750 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL23AP62750 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms