Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNRPD3P62318 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms