Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP46P62068 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP46P62068 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP46P62068 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP46P62068 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP46P62068 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP46P62068 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP46P62068 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP46P62068 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP46P62068 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP46P62068 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP46P62068 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP46P62068 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP46P62068 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP46P62068 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP46P62068 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP46P62068 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP46P62068 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP46P62068 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP46P62068 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP46P62068 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP46P62068 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP46P62068 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP46P62068 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP46P62068 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP46P62068 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP46P62068 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP46P62068 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP46P62068 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP46P62068 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP46P62068 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP46P62068 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP46P62068 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP46P62068 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP46P62068 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP46P62068 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP46P62068 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP46P62068 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP46P62068 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP46P62068 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP46P62068 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP46P62068 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP46P62068 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP46P62068 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP46P62068 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP46P62068 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP46P62068 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP46P62068 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP46P62068 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP46P62068 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP46P62068 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP46P62068 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP46P62068 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP46P62068 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP46P62068 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP46P62068 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP46P62068 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP46P62068 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP46P62068 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP46P62068 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP46P62068 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP46P62068 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP46P62068 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP46P62068 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP46P62068 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP46P62068 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP46P62068 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP46P62068 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP46P62068 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms