Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOAP61586 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOAP61586 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOAP61586 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOAP61586 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOAP61586 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOAP61586 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOAP61586 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOAP61586 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOAP61586 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOAP61586 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOAP61586 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOAP61586 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOAP61586 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOAP61586 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOAP61586 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOAP61586 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOAP61586 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOAP61586 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOAP61586 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOAP61586 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOAP61586 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOAP61586 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOAP61586 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOAP61586 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOAP61586 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOAP61586 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOAP61586 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOAP61586 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOAP61586 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOAP61586 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOAP61586 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOAP61586 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOAP61586 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOAP61586 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOAP61586 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOAP61586 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOAP61586 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOAP61586 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOAP61586 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOAP61586 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOAP61586 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOAP61586 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOAP61586 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOAP61586 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOAP61586 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOAP61586 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOAP61586 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOAP61586 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOAP61586 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOAP61586 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOAP61586 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOAP61586 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOAP61586 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOAP61586 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOAP61586 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOAP61586 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOAP61586 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOAP61586 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOAP61586 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOAP61586 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOAP61586 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOAP61586 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms