Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSCP56915 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSCP56915 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSCP56915 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSCP56915 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSCP56915 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSCP56915 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSCP56915 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSCP56915 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSCP56915 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSCP56915 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSCP56915 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSCP56915 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSCP56915 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSCP56915 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSCP56915 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSCP56915 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSCP56915 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSCP56915 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GSCP56915 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSCP56915 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSCP56915 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSCP56915 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSCP56915 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GSCP56915 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSCP56915 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSCP56915 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSCP56915 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSCP56915 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSCP56915 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSCP56915 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSCP56915 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSCP56915 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSCP56915 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSCP56915 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSCP56915 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSCP56915 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSCP56915 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GSCP56915 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSCP56915 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GSCP56915 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSCP56915 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSCP56915 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GSCP56915 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSCP56915 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSCP56915 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSCP56915 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSCP56915 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSCP56915 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSCP56915 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSCP56915 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSCP56915 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GSCP56915 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GSCP56915 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSCP56915 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSCP56915 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSCP56915 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSCP56915 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSCP56915 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSCP56915 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSCP56915 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSCP56915 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSCP56915 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSCP56915 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GSCP56915 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSCP56915 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSCP56915 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GSCP56915 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSCP56915 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSCP56915 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSCP56915 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSCP56915 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSCP56915 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSCP56915 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSCP56915 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSCP56915 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSCP56915 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSCP56915 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSCP56915 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSCP56915 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GSCP56915 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSCP56915 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSCP56915 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSCP56915 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSCP56915 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSCP56915 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSCP56915 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSCP56915 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSCP56915 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSCP56915 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSCP56915 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSCP56915 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSCP56915 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSCP56915 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSCP56915 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSCP56915 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSCP56915 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSCP56915 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSCP56915 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSCP56915 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms