Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP1P56182 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP1P56182 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP1P56182 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP1P56182 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP1P56182 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP1P56182 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP1P56182 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP1P56182 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP1P56182 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP1P56182 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1P56182 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1P56182 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1P56182 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1P56182 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1P56182 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1P56182 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1P56182 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1P56182 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1P56182 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1P56182 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP1P56182 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP1P56182 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP1P56182 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP1P56182 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP1P56182 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP1P56182 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP1P56182 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RRP1P56182 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP1P56182 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP1P56182 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP1P56182 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP1P56182 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP1P56182 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP1P56182 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP1P56182 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP1P56182 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP1P56182 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP1P56182 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP1P56182 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1P56182 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1P56182 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1P56182 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1P56182 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1P56182 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1P56182 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1P56182 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1P56182 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP1P56182 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1P56182 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1P56182 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1P56182 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1P56182 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1P56182 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1P56182 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1P56182 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1P56182 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1P56182 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1P56182 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1P56182 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP1P56182 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP1P56182 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP1P56182 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP1P56182 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP1P56182 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP1P56182 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP1P56182 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP1P56182 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP1P56182 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP1P56182 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP1P56182 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP1P56182 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP1P56182 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP1P56182 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP1P56182 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP1P56182 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP1P56182 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP1P56182 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1P56182 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1P56182 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1P56182 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1P56182 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1P56182 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1P56182 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1P56182 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1P56182 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1P56182 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1P56182 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1P56182 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP1P56182 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1P56182 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1P56182 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1P56182 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1P56182 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1P56182 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1P56182 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1P56182 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1P56182 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP1P56182 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP1P56182 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms