Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH8P55286 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH8P55286 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH8P55286 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH8P55286 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH8P55286 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH8P55286 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH8P55286 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH8P55286 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH8P55286 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH8P55286 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH8P55286 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH8P55286 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH8P55286 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH8P55286 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH8P55286 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH8P55286 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH8P55286 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH8P55286 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH8P55286 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH8P55286 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH8P55286 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH8P55286 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH8P55286 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH8P55286 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH8P55286 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH8P55286 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH8P55286 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH8P55286 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH8P55286 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH8P55286 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH8P55286 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH8P55286 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH8P55286 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH8P55286 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH8P55286 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH8P55286 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH8P55286 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH8P55286 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH8P55286 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH8P55286 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH8P55286 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH8P55286 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH8P55286 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH8P55286 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH8P55286 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH8P55286 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH8P55286 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH8P55286 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH8P55286 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH8P55286 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH8P55286 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH8P55286 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH8P55286 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH8P55286 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH8P55286 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH8P55286 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH8P55286 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH8P55286 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH8P55286 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH8P55286 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH8P55286 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH8P55286 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH8P55286 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH8P55286 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH8P55286 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH8P55286 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH8P55286 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH8P55286 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH8P55286 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms