Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NAP1L1P55209 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAP1L1P55209 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms