Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRPF1P55201 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRPF1P55201 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF1P55201 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms