Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GYS2P54840 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GYS2P54840 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GYS2P54840 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GYS2P54840 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GYS2P54840 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GYS2P54840 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GYS2P54840 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GYS2P54840 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GYS2P54840 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GYS2P54840 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GYS2P54840 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GYS2P54840 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GYS2P54840 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GYS2P54840 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GYS2P54840 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GYS2P54840 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GYS2P54840 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GYS2P54840 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GYS2P54840 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GYS2P54840 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GYS2P54840 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GYS2P54840 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GYS2P54840 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GYS2P54840 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GYS2P54840 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GYS2P54840 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GYS2P54840 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GYS2P54840 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
GYS2P54840 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GYS2P54840 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GYS2P54840 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GYS2P54840 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GYS2P54840 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GYS2P54840 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GYS2P54840 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GYS2P54840 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GYS2P54840 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GYS2P54840 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GYS2P54840 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GYS2P54840 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GYS2P54840 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GYS2P54840 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GYS2P54840 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GYS2P54840 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GYS2P54840 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GYS2P54840 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GYS2P54840 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GYS2P54840 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GYS2P54840 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GYS2P54840 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GYS2P54840 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GYS2P54840 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GYS2P54840 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GYS2P54840 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GYS2P54840 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GYS2P54840 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GYS2P54840 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GYS2P54840 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GYS2P54840 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GYS2P54840 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GYS2P54840 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GYS2P54840 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GYS2P54840 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms