Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHB4P54760 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB4P54760 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms