Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA8P53708 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA8P53708 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms