Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PGGT1BP53609 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PGGT1BP53609 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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