Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

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Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 BLM10YFL007W 6432 nt5.1□□□□□ -1.59
SSK2P53599 RHO3YIL118W 696 nt5.1□□□□□ -1.59
SSK2P53599 YMR087WYMR087W 855 nt5.1□□□□□ -1.59
SSK2P53599 TPK2YPL203W 1143 nt5.1□□□□□ -1.59
SSK2P53599 GYP6YJL044C 1377 nt5.1□□□□□ -1.59
SSK2P53599 NMD2YHR077C 3270 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK2P53599 YER084WYER084W 387 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK2P53599 SKI6YGR195W 741 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK2P53599 REE1YJL217W 597 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK2P53599 ALA1YOR335C 2877 nt5.09□□□□□ -1.59
SSK2P53599 GCN5YGR252W 1320 nt5.09□□□□□ -1.6
SSK2P53599 XRS2YDR369C 2565 nt5.09□□□□□ -1.6
SSK2P53599 CUE3YGL110C 1875 nt5.09□□□□□ -1.6
SSK2P53599 ASI1YMR119W 1875 nt5.09□□□□□ -1.6
SSK2P53599 SSB1YDL229W 1842 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK2P53599 SED5YLR026C 1023 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK2P53599 RRG9YNL213C 645 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK2P53599 RPL18AYOL120C 561 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK2P53599 VHC1YBR235W 3363 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK2P53599 FMP30YPL103C 1407 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK2P53599 TIP20YGL145W 2106 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK2P53599 GRC3YLL035W 1899 nt5.08□□□□□ -1.6
SSK2P53599 YPK9YOR291W 4419 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK2P53599 MEK1YOR351C 1494 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK2P53599 CLD1YGR110W 1338 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK2P53599 SUP45YBR143C 1314 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK2P53599 RAD26YJR035W 3258 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK2P53599 YOL107WYOL107W 1029 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK2P53599 YOR331CYOR331C 558 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK2P53599 RPS12YOR369C 432 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK2P53599 SIS2YKR072C 1689 nt5.07□□□□□ -1.6
SSK2P53599 NFT1YKR103W 3657 nt5.06□□□□□ -1.6
SSK2P53599 HOT1YMR172W 2160 nt5.06□□□□□ -1.6
SSK2P53599 YLR001CYLR001C 2589 nt5.06□□□□□ -1.6
SSK2P53599 YPL113CYPL113C 1191 nt5.06□□□□□ -1.6
SSK2P53599 DPB2YPR175W 2070 nt5.06□□□□□ -1.6
SSK2P53599 CMR1YDL156W 1569 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK2P53599 YLR339CYLR339C 552 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK2P53599 DHR2YKL078W 2208 nt5.05□□□□□ -1.6
SSK2P53599 CDC40YDR364C 1368 nt5.04□□□□□ -1.6
SSK2P53599 YHL049CYHL049C 816 nt5.04□□□□□ -1.6
SSK2P53599 DAN4YJR151C 3486 nt5.03□□□□□ -1.6
SSK2P53599 GFA1YKL104C 2154 nt5.03□□□□□ -1.6
SSK2P53599 HER2YMR293C 1395 nt5.03□□□□□ -1.6
SSK2P53599 REC8YPR007C 2043 nt5.03□□□□□ -1.6
SSK2P53599 FRE8YLR047C 2061 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK2P53599 ARO9YHR137W 1542 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK2P53599 EPL1YFL024C 2499 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK2P53599 YJR085CYJR085C 318 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK2P53599 STR2YJR130C 1920 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK2P53599 VPS41YDR080W 2979 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK2P53599 SEC27YGL137W 2670 nt5.02□□□□□ -1.61
SSK2P53599 MIG3YER028C 1185 nt5.01□□□□□ -1.61
SSK2P53599 FAA2YER015W 2235 nt5.01□□□□□ -1.61
SSK2P53599 PRP43YGL120C 2304 nt5.01□□□□□ -1.61
SSK2P53599 CIT1YNR001C 1440 nt5□□□□□ -1.61
SSK2P53599 KRE5YOR336W 4098 nt5□□□□□ -1.61
SSK2P53599 PPZ1YML016C 2079 nt5□□□□□ -1.61
SSK2P53599 YDL176WYDL176W 2127 nt5□□□□□ -1.61
SSK2P53599 TOM7YNL070W 183 nt5□□□□□ -1.61
SSK2P53599 YDR306CYDR306C 1437 nt5□□□□□ -1.61
SSK2P53599 IKI3YLR384C 4050 nt5□□□□□ -1.61
SSK2P53599 NNK1YKL171W 2787 nt5□□□□□ -1.61
SSK2P53599 RPL23BYER117W 414 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK2P53599 PNG1YPL096W 1092 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK2P53599 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK2P53599 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK2P53599 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK2P53599 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK2P53599 YAR069CYAR069C 294 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK2P53599 CCW14YLR390W-A 717 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK2P53599 DIB1YPR082C 432 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK2P53599 MUP3YHL036W 1641 nt4.99□□□□□ -1.61
SSK2P53599 BCH1YMR237W 2175 nt4.98□□□□□ -1.61
SSK2P53599 YKL107WYKL107W 930 nt4.98□□□□□ -1.61
SSK2P53599 NIS1YNL078W 1224 nt4.98□□□□□ -1.61
SSK2P53599 CHS3YBR023C 3498 nt4.98□□□□□ -1.61
SSK2P53599 YAK1YJL141C 2424 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK2P53599 PPH3YDR075W 927 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK2P53599 HAL5YJL165C 2568 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK2P53599 KCH1YJR054W 1494 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK2P53599 NUP133YKR082W 3474 nt4.97□□□□□ -1.61
SSK2P53599 DOG1YHR044C 741 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK2P53599 COA2YPL189C-A 207 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK2P53599 GPI18YBR004C 1302 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK2P53599 VTC4YJL012C 2166 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK2P53599 ATG2YNL242W 4779 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK2P53599 SPT6YGR116W 4356 nt4.96□□□□□ -1.62
SSK2P53599 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.95□□□□□ -1.62
SSK2P53599 YOR022CYOR022C 2148 nt4.95□□□□□ -1.62
SSK2P53599 GRE1YPL223C 507 nt4.95□□□□□ -1.62
SSK2P53599 RPL36BYPL249C-A 303 nt4.95□□□□□ -1.62
SSK2P53599 TAF1YGR274C 3201 nt4.95□□□□□ -1.62
SSK2P53599 VPS64YDR200C 1815 nt4.95□□□□□ -1.62
SSK2P53599 GUP1YGL084C 1683 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK2P53599 MPA43YNL249C 1629 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK2P53599 MET7YOR241W 1647 nt4.94□□□□□ -1.62
SSK2P53599 SSE2YBR169C 2082 nt4.93□□□□□ -1.62
SSK2P53599 GAS4YOL132W 1416 nt4.93□□□□□ -1.62
SSK2P53599 YLR257WYLR257W 966 nt4.93□□□□□ -1.62
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