Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUBP1P53384 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUBP1P53384 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms