Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP98P52948 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP98P52948 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP98P52948 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP98P52948 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP98P52948 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP98P52948 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP98P52948 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP98P52948 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP98P52948 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP98P52948 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP98P52948 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP98P52948 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP98P52948 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP98P52948 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP98P52948 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP98P52948 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP98P52948 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP98P52948 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP98P52948 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP98P52948 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP98P52948 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP98P52948 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP98P52948 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP98P52948 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP98P52948 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP98P52948 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP98P52948 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP98P52948 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP98P52948 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP98P52948 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP98P52948 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP98P52948 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP98P52948 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP98P52948 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP98P52948 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP98P52948 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NUP98P52948 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
NUP98P52948 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
NUP98P52948 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP98P52948 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP98P52948 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP98P52948 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP98P52948 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP98P52948 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP98P52948 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP98P52948 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP98P52948 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP98P52948 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP98P52948 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP98P52948 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP98P52948 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP98P52948 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP98P52948 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP98P52948 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP98P52948 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP98P52948 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP98P52948 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP98P52948 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP98P52948 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP98P52948 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP98P52948 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP98P52948 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP98P52948 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP98P52948 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP98P52948 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP98P52948 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP98P52948 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP98P52948 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP98P52948 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP98P52948 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP98P52948 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP98P52948 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP98P52948 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP98P52948 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP98P52948 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP98P52948 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP98P52948 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP98P52948 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP98P52948 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP98P52948 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP98P52948 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP98P52948 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP98P52948 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP98P52948 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP98P52948 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP98P52948 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP98P52948 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP98P52948 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP98P52948 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP98P52948 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP98P52948 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP98P52948 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP98P52948 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP98P52948 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP98P52948 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP98P52948 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP98P52948 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP98P52948 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP98P52948 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms