Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK3P51956 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK3P51956 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK3P51956 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK3P51956 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK3P51956 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK3P51956 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK3P51956 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK3P51956 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK3P51956 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK3P51956 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK3P51956 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK3P51956 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK3P51956 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK3P51956 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK3P51956 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK3P51956 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK3P51956 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK3P51956 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK3P51956 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK3P51956 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK3P51956 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK3P51956 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK3P51956 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK3P51956 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK3P51956 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK3P51956 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK3P51956 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK3P51956 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK3P51956 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK3P51956 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK3P51956 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK3P51956 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK3P51956 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK3P51956 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEK3P51956 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEK3P51956 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEK3P51956 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEK3P51956 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEK3P51956 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEK3P51956 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK3P51956 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK3P51956 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK3P51956 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK3P51956 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK3P51956 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK3P51956 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK3P51956 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK3P51956 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK3P51956 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK3P51956 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK3P51956 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK3P51956 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK3P51956 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK3P51956 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK3P51956 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK3P51956 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK3P51956 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK3P51956 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK3P51956 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK3P51956 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK3P51956 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK3P51956 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK3P51956 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK3P51956 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK3P51956 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK3P51956 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK3P51956 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms