Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2D1P51668 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UBE2D1P51668 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms