Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCAMP50895 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAMP50895 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAMP50895 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAMP50895 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAMP50895 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAMP50895 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAMP50895 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAMP50895 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAMP50895 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAMP50895 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAMP50895 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAMP50895 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAMP50895 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCAMP50895 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCAMP50895 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCAMP50895 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCAMP50895 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCAMP50895 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCAMP50895 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCAMP50895 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
BCAMP50895 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAMP50895 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAMP50895 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAMP50895 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAMP50895 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAMP50895 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAMP50895 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAMP50895 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAMP50895 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAMP50895 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCAMP50895 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCAMP50895 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAMP50895 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAMP50895 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAMP50895 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAMP50895 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAMP50895 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAMP50895 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAMP50895 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAMP50895 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAMP50895 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAMP50895 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCAMP50895 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCAMP50895 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCAMP50895 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCAMP50895 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCAMP50895 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCAMP50895 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCAMP50895 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCAMP50895 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BCAMP50895 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCAMP50895 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCAMP50895 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCAMP50895 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCAMP50895 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCAMP50895 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCAMP50895 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCAMP50895 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BCAMP50895 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCAMP50895 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCAMP50895 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCAMP50895 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCAMP50895 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BCAMP50895 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BCAMP50895 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAMP50895 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAMP50895 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAMP50895 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAMP50895 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAMP50895 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAMP50895 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAMP50895 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAMP50895 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAMP50895 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAMP50895 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCAMP50895 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCAMP50895 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms