Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK7P50613 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK7P50613 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK7P50613 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK7P50613 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK7P50613 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK7P50613 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK7P50613 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK7P50613 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK7P50613 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK7P50613 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK7P50613 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK7P50613 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK7P50613 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK7P50613 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK7P50613 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK7P50613 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK7P50613 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK7P50613 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK7P50613 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK7P50613 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK7P50613 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK7P50613 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK7P50613 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK7P50613 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK7P50613 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK7P50613 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK7P50613 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK7P50613 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK7P50613 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK7P50613 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK7P50613 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK7P50613 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK7P50613 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK7P50613 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK7P50613 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK7P50613 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK7P50613 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK7P50613 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK7P50613 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK7P50613 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK7P50613 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK7P50613 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK7P50613 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK7P50613 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK7P50613 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK7P50613 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK7P50613 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK7P50613 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK7P50613 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK7P50613 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK7P50613 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK7P50613 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK7P50613 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK7P50613 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK7P50613 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK7P50613 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK7P50613 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK7P50613 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK7P50613 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK7P50613 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK7P50613 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK7P50613 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK7P50613 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK7P50613 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK7P50613 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK7P50613 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK7P50613 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK7P50613 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK7P50613 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK7P50613 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK7P50613 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK7P50613 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK7P50613 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK7P50613 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK7P50613 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK7P50613 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK7P50613 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK7P50613 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK7P50613 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK7P50613 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK7P50613 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK7P50613 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK7P50613 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK7P50613 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms