Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBP50607 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBP50607 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBP50607 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBP50607 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBP50607 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBP50607 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBP50607 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBP50607 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBP50607 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBP50607 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBP50607 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBP50607 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBP50607 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBP50607 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBP50607 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBP50607 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBP50607 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBP50607 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBP50607 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBP50607 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBP50607 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBP50607 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBP50607 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBP50607 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBP50607 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBP50607 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBP50607 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBP50607 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBP50607 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBP50607 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBP50607 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBP50607 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBP50607 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBP50607 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBP50607 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBP50607 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBP50607 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBP50607 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBP50607 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBP50607 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBP50607 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBP50607 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBP50607 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBP50607 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBP50607 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBP50607 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBP50607 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBP50607 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBP50607 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBP50607 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBP50607 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBP50607 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBP50607 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBP50607 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBP50607 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBP50607 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBP50607 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBP50607 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBP50607 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBP50607 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBP50607 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBP50607 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBP50607 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBP50607 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBP50607 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBP50607 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBP50607 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBP50607 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBP50607 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBP50607 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBP50607 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBP50607 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBP50607 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBP50607 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBP50607 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBP50607 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBP50607 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBP50607 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBP50607 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBP50607 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms