Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF10P50591 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF10P50591 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFSF10P50591 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFSF10P50591 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFSF10P50591 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFSF10P50591 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF10P50591 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF10P50591 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms