Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRE11P49959 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRE11P49959 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRE11P49959 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRE11P49959 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRE11P49959 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRE11P49959 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRE11P49959 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRE11P49959 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRE11P49959 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRE11P49959 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRE11P49959 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRE11P49959 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRE11P49959 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRE11P49959 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRE11P49959 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRE11P49959 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRE11P49959 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRE11P49959 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRE11P49959 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRE11P49959 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRE11P49959 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRE11P49959 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRE11P49959 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRE11P49959 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRE11P49959 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRE11P49959 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRE11P49959 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRE11P49959 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRE11P49959 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRE11P49959 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRE11P49959 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRE11P49959 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRE11P49959 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRE11P49959 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRE11P49959 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRE11P49959 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRE11P49959 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRE11P49959 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRE11P49959 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRE11P49959 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRE11P49959 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRE11P49959 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRE11P49959 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRE11P49959 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRE11P49959 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MRE11P49959 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRE11P49959 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MRE11P49959 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRE11P49959 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRE11P49959 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRE11P49959 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRE11P49959 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRE11P49959 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRE11P49959 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRE11P49959 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRE11P49959 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRE11P49959 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRE11P49959 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRE11P49959 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRE11P49959 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRE11P49959 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRE11P49959 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRE11P49959 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRE11P49959 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRE11P49959 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRE11P49959 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRE11P49959 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MRE11P49959 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRE11P49959 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRE11P49959 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRE11P49959 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRE11P49959 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRE11P49959 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRE11P49959 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRE11P49959 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRE11P49959 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRE11P49959 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRE11P49959 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRE11P49959 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MRE11P49959 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRE11P49959 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRE11P49959 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MRE11P49959 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MRE11P49959 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRE11P49959 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRE11P49959 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRE11P49959 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRE11P49959 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRE11P49959 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRE11P49959 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRE11P49959 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRE11P49959 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRE11P49959 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRE11P49959 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRE11P49959 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRE11P49959 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRE11P49959 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRE11P49959 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRE11P49959 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms