Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A11P48066 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A11P48066 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms