Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRIA4P48058 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIA4P48058 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA4P48058 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms