Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RGRP47804 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGRP47804 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RGRP47804 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGRP47804 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGRP47804 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGRP47804 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGRP47804 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGRP47804 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGRP47804 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGRP47804 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGRP47804 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGRP47804 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGRP47804 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGRP47804 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGRP47804 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGRP47804 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGRP47804 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGRP47804 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGRP47804 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RGRP47804 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RGRP47804 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGRP47804 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGRP47804 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGRP47804 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGRP47804 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGRP47804 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGRP47804 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGRP47804 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGRP47804 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGRP47804 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGRP47804 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGRP47804 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGRP47804 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGRP47804 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RGRP47804 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGRP47804 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGRP47804 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGRP47804 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGRP47804 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGRP47804 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGRP47804 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RGRP47804 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RGRP47804 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RGRP47804 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RGRP47804 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGRP47804 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGRP47804 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGRP47804 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGRP47804 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGRP47804 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGRP47804 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGRP47804 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGRP47804 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGRP47804 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RGRP47804 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RGRP47804 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGRP47804 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGRP47804 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGRP47804 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGRP47804 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGRP47804 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGRP47804 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGRP47804 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGRP47804 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGRP47804 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms