Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRXP46100 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRXP46100 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRXP46100 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRXP46100 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRXP46100 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRXP46100 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRXP46100 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRXP46100 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRXP46100 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRXP46100 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRXP46100 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRXP46100 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRXP46100 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRXP46100 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRXP46100 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRXP46100 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRXP46100 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRXP46100 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRXP46100 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRXP46100 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRXP46100 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRXP46100 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRXP46100 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATRXP46100 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRXP46100 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRXP46100 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRXP46100 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRXP46100 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRXP46100 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRXP46100 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRXP46100 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRXP46100 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRXP46100 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRXP46100 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRXP46100 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATRXP46100 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRXP46100 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRXP46100 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRXP46100 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATRXP46100 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRXP46100 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRXP46100 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRXP46100 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRXP46100 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATRXP46100 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATRXP46100 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRXP46100 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRXP46100 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRXP46100 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRXP46100 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRXP46100 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRXP46100 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRXP46100 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRXP46100 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRXP46100 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRXP46100 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRXP46100 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATRXP46100 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRXP46100 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRXP46100 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRXP46100 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRXP46100 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRXP46100 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRXP46100 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRXP46100 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRXP46100 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRXP46100 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATRXP46100 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRXP46100 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRXP46100 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRXP46100 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRXP46100 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRXP46100 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRXP46100 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRXP46100 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRXP46100 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRXP46100 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRXP46100 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRXP46100 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRXP46100 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRXP46100 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRXP46100 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATRXP46100 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRXP46100 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms