Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKI67P46013 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MKI67P46013 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKI67P46013 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKI67P46013 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKI67P46013 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKI67P46013 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKI67P46013 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MKI67P46013 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKI67P46013 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKI67P46013 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKI67P46013 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MKI67P46013 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKI67P46013 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKI67P46013 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKI67P46013 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKI67P46013 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKI67P46013 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKI67P46013 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKI67P46013 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKI67P46013 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKI67P46013 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKI67P46013 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKI67P46013 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MKI67P46013 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKI67P46013 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKI67P46013 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKI67P46013 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKI67P46013 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKI67P46013 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKI67P46013 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKI67P46013 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKI67P46013 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKI67P46013 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKI67P46013 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKI67P46013 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKI67P46013 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKI67P46013 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKI67P46013 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MKI67P46013 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKI67P46013 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKI67P46013 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKI67P46013 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKI67P46013 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKI67P46013 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKI67P46013 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKI67P46013 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKI67P46013 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKI67P46013 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKI67P46013 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKI67P46013 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKI67P46013 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKI67P46013 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKI67P46013 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKI67P46013 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKI67P46013 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKI67P46013 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKI67P46013 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKI67P46013 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKI67P46013 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKI67P46013 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKI67P46013 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MKI67P46013 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKI67P46013 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKI67P46013 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKI67P46013 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKI67P46013 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKI67P46013 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MKI67P46013 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKI67P46013 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKI67P46013 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKI67P46013 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKI67P46013 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKI67P46013 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKI67P46013 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MKI67P46013 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKI67P46013 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKI67P46013 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKI67P46013 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKI67P46013 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKI67P46013 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKI67P46013 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKI67P46013 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKI67P46013 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKI67P46013 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms