Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ACADSBP45954 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms